Encapsulation de lysats de buffy-coats
L’encapsulation de lysats de buffy-coats assure la conservation de l’ADN de lysat de buffy-coat au long terme à température ambiante. Elle permet de planifier l’extraction ultérieure d’ADN de ces échantillons précieux et d’éviter les coûts de stockage au froid des buffy-coats, tout en garantissant une qualité d’ADN optimum sur le long terme. Chaque minicapsule contient un équivalent de ~3 µg d’ADN.
Référencement et réception des échantillons
La plateforme peut recevoir soit du sang total, soit des buffy-coat préparés par le client à partir de sang total, soit les buffy-coat déjà lysés par le client (dans ce cas, la plateforme de service fournit la solution et le protocole de lyse).
Les échantillons sont référencés dans le LIMS (Laboratory Information Management System) avant leur arrivée sur la plateforme de service, où ils sont étiquetés avec un code unique généré par le LIMS (étiquette code à barres). D’autres options de référencement sont possibles, comme l’étiquetage par le client avant l’envoi des échantillons.
La procédure de transport des échantillons biologiques et la température de conservation à réception sont définies avec le client, en conformité avec les règles de biosécurité et de biosûreté (voir le règlement de service, consultable sur demande).
Préparation des buffy-coats (optionnelle)
Les buffy-coat sont préparés à partir de sang total frais.
Lyse des buffy coat
Les échantillons de buffy coat sont lysés dans une solution de lyse et de stabilisation (propriété Imagene) optimisée spécifiquement pour la conservation des ADN dans les buffy-coats encapsulés.
Aliquotage des lysats
Cette opération entièrement automatisée permet de répartir chaque échantillon de lysat dans le nombre de minicapsules demandées par le client.
Lors de cette opération, le code à barres de chaque échantillon est associé aux codes Datamatrix de ses minicapsules et les informations sont automatiquement enregistrées dans le LIMS.
Dessiccation
Au cours de cette étape, les échantillons subissent une déshydratation primaire par le vide dans un évapo-concentrateur permettant de maîtriser les différents paramètres de séchage (descente en pression, température de l’enceinte).
Encapsulation
Après l’étape de dessiccation primaire, les portoirs d’étuis ainsi que les bouchons sont introduits dans une enceinte garantissant un environnement contrôlé (anoxique, anhydre) et inerte (argon, hélium).
Sous cette atmosphère, à l’abri des facteurs d’altération, l’étui et le bouchon de chaque minicapsule sont assemblés et scellés par soudage Laser YAG pulsé pour une étanchéité rigoureuse, sans élévation de température.
Chaque minicapsule subit après soudage, un contrôle d’étanchéité systématique effectué par un détecteur de fuites (détection d’hélium par spectrométrie de masse), permettant de garantir une étanchéité rigoureuse. En cas de fuite détectée, l’échantillon est ré-encapsulé.
Livraison des minicapsules
Les minicapsules sont livrées sur leurs portoirs de stockage à l’adresse indiquée par le client ou stockées pour compte sur la plateforme. Les données de correspondance entre les identifiants du client et les codes 2D des minicapsules (et les données de contrôle qualité le cas échéant), sont également exportées de la base de données du LIMS et fournies lors de la livraison.